Das FNZ Potsdam pflegt Kooperationsbeziehungen zu zahlreichen Kultureinrichtungen im Land Brandenburg, in der Landeshauptstadt Potsdam und in Berlin und ist so fest in der Region verankert. Die Kooperationspartner sind über das Modul „Forschungsbezogene Praxisfelder“ auch am beim Zentrum angesiedelten Masterstudienganges beteigligt.