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High Performance Computing (HPC)

Illustration zum Dienst High Performance Computing HPC
Foto: ZIM

Das ZIM betreibt einen Compute-Cluster für Hochleistungsrechnen (High Performance Computing, HPC) für die Universität Potsdam und unterstützt Angehörige der UP bei der Nutzung des Supercomputer-Systems des Norddeutschen Verbundes für Hoch- und Höchstleistungsrechnen (HLRN) bzw. des Nationalen Hochleistungsrechnens (NHR).

Der UP-eigene Compute-Cluster ist unter dem Hostnamen "login1.hpc.uni-potsdam.de" erreichbar. Es handelt sich um einen Cluster aus

  • redundant ausgelegten Head-Nodes,
  • redundant ausgelegten Fileservern und Anbindung an das ZIM-SAN
  • mind. 12 Compute-Nodes mit aktueller CPU-Architektur, davon mehrere mit GPUs (je 3 Nvidia V100)

Alle Knoten sind über ein schnelles Infiniband-Netzwerk miteinander verbunden.

Die Speichersysteme sind von den Head-Nodes und allen Rechenknoten erreichbar. Die Daten auf dem Scratch-Speicher werden nicht von uns gesichert, die Nutzer sind also selbst dafür verantwortlich, längerfristig benötigte Daten zu sichern.

Die Verteilung der Rechenjobs auf die Knoten erfolgt durch den Job- und Ressourcen-Scheduler "SLURM". Der direkte Zugriff der Nutzerinnen und Nutzer auf die Rechenknoten ist ohne Job- bzw. Ressourcen-Allokation nicht möglich.

Illustration zum Dienst High Performance Computing HPC
Foto: ZIM

Aktuelles

Die Nutzerdokumentation zum HPC-Cluster der Universität Potsdam finden Sie unter diesem Link: https://docs.hpc.uni-potsdam.de/

Dashboards: https://monitor.hpc.uni-potsdam.de

Scratch-Storage: Der momentan relativ begrenzte Scratch-Speicher /work wird um ca. 50TB erweitert, um die effiziente Bearbeitung datenintensiver Jobs zu ermöglichen. Die Erweiterung wird eine Downtime verursachen, über die zu gegebener Zeit via Mail-Verteiler informiert wird.

Erste Schritte: https://docs.hpc.uni-potsdam.de/overview/first_steps.html

Hinweise für neue Nutzerinnen und Nutzer des Compute-Clusters

Wie Sie Zugang zum HPC-Cluster der Universität Potsdam erhalten finden Sie auf diesen Seiten https://docs.hpc.uni-potsdam.de/overview/getting_access.html

Diese Seiten sind nur aus dem Uni-Netz erreichbar.

  • Besorgen Sie sich für Ihren lokalen Rechner einen ssh-Client (falls Sie ihn nicht schon haben), und generieren Sie ein Schlüsselpaar im Format ed25519, z.B. “ssh-keygen -t ed25519“.
  • Um den Zugang freizuschalten, melden Sie sich in Account.UP an, und navigieren Sie zur Seite Sonstiges → High Performance Computing, wo Sie Ihren SSH-Schlüssel eintragen (sowie optional einer Arbeitsgruppe beitreten) können.

Technische Details

Informationen zur Nutzung des HLRN (Norddeutscher Verbund für Hoch- und Höchstleistungsrechnen)

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